萤光素是用于体内成像萤光素酶表达的常见生物发光报告 基因。萤火虫荧光素酶的这种水溶性底物利用ATP和Mg 2+作为辅因子，在有氧存在的情况下发出特征性的黄绿色发射光，在37°C的温度下会在体内转变为红光。通过利用ATP，该反应可进一步用于指示能量或生命的存在，以充当生命死亡的污点。

萤光素是整个生物技术领域常用的试剂，特别是用于 体内成像。通常将萤光素酶标记的肿瘤细胞，干细胞或传染性疾病接种到研究动物（例如大鼠或小鼠）中进行研究。荧光素的注射允许通过生物发光成像（BLI）实时，无创地监测这些模型系统中的疾病进展和/或药物功效。

萤光素也通常用于 体外研究，包括萤光素酶和ATP测定，基因报告基因测定，高通量测序和各种污染测定。